Shakespeare passte sich der offiziellen Staatsreligion an, aber seine privaten Ansichten zur Religion waren Gegenstand von Debatten.
Shakespeares Testament verwendet eine protestantische Formel und er war ein bestätigtes Mitglied der Church of England, wo er verheiratet war, seine Kinder getauft wurden und wo er begraben liegt. Einige Gelehrte behaupten, dass Mitglieder von Shakespeares Familie Katholiken waren, zu einer Zeit, als das Praktizieren des Katholizismus in England gegen das Gesetz verstieß.
Shakespeares Mutter Mary Arden stammte zweifellos aus einer frommen katholischen Familie. Der stärkste Beweis könnte eine katholische Glaubenserklärung sein, die von seinem Vater John Shakespeare unterzeichnet wurde und 1757 in den Sparren seines ehemaligen Hauses in der Henley Street gefunden wurde. Das Dokument ist jedoch jetzt verloren und die Gelehrten unterscheiden sich hinsichtlich seiner Echtheit.
Im Jahr 1591 berichteten die Behörden, dass John Shakespeare die Kirche "aus Angst vor einem Schuldenprozess" verpasst hatte, eine übliche katholische Ausrede.
1606 erscheint der Name von Williams Tochter Susanna auf einer Liste derer, die die Osterkommunion in Stratford nicht besucht haben.
Andere Autoren argumentieren, dass es an Beweisen für Shakespeares religiöse Überzeugungen mangelt. Gelehrte finden Beweise sowohl für als auch gegen Shakespeares Katholizismus, Protestantismus oder mangelnden Glauben an seine Stücke, aber die Wahrheit kann unmöglich zu beweisen sein.
